口岸傳染病電子監管系統采用集中分布式的部署方式，遵循“總體規劃，分布實施，穩步推進”的原則，逐步形成清晰、完整的體系脈絡，實現系統功能穩定、運行順暢的要求。 實現了總局管理平臺、直屬局、口岸單位、保健中心的數據大集中和信息共享，現有15個直屬局及所屬保健中心、口岸單位實現了全局數據聯網應用，通過ORACLE Stream及其他技術實現數據的報送和分發，從而實現了數據的共享和應用，目前系統運行穩定、順暢。
已完成35個直屬局內122個保健中心及50多家口岸單位的安裝，除部分口岸單位自行安裝外，根據各地使用單位要求，都制定了針對性的系統上線部署實施方案和培訓方案，開展上門針對性應用培訓上百人次，在系統上線安裝調試服務期間，對系統操作人員進行系統應用培訓，既采取集中式整體培訓和一對一崗位應用培訓外；還對軟件系統管理員進行數據庫和應用軟件的安裝、數據庫維護計劃定制、網絡維護、軟硬件故障解決、軟件升級等內容的系統維護培訓，系統正式運行后，提供實時的日常遠程技術指導。
現有25個直屬局、107個保健中心、40多家口岸單位日常業務正式使用該系統。